L'onglet Calques permet de gerer commodément les images comportant plusieurs calques.

Les divers calques créés sont empilés de bas en  haut comme on le faisait  lors de présentations avec un rétro-projecteur. Chaque calque recouvre  tous ceux qui sont au dessous de lui

Gimp donne, par défaut des noms aux calques. Lorsqu'une image est ouverte, elle ne comporte qu'un seul calque nommé Arrière Plan. Si on duplique le calque, le nouveau calque créé s'appelle Copie d'arrière Plan.

En  double-cliquant sur le nom d'un calque il est possible de le modifier pour qu'il soit plus explicite : par exemple Fond, Personnage1, Personnage2,...., Reflet,   ,Fleur,.....

Parmi tous les calques, un seul est actif , c'est celui qui possède une bande légèrement colorée.

Les calques peuvent  être rendus invisibles en cliquant sur l'oeil qui donne la visibilité du calque.

Un calque peut être rendu plus ou moins transparent en ajustant le curseur réglant l'opacité du calque.

Les modes de fusion des calques permettent à un calque d'agir sur celui qui est au dessous de lui, pixel par pixel, par des opérations offrant toute une gamme de possibiltés.